Avec pas mal de prétendents tels que Wisconsin, Georgetown ou Duke, Patrick Baldwin Jr a finalement choisi l'université de Milwaukee. Quatrième meilleure recrue selon ESPN, Baldwin aurait pu permettre aux Blue Devils de passer meilleur recrutement universitaire. Il aurait pu devenir la recrue la mieux notée de l'histoire des Hoyas. Mais il en a décidé autrement, et ce sera finalement l'université de Milwaukee (où entraîne son père). Le prospect cinq étoiles rejoint un programme entraîné depuis cinq saisons par son père avec un bilan de 47 victoires pour 70 défaites. En effet, les panthères n'ont pas encore réalisé de saison positive (plus de 50% de victoires) et ont affiché un bilan de 10-12 la saison dernière. Le natif du Wisconsin rejoindra par ailleurs le Deandre Gholston meilleur scoreur de son équipe avec plus de 18 points de moyenne.
Considéré comme un potentiel 3 and D, Patrick Baldwin Jr affichait une moyenne de 23 points et 10 rebonds lors de sa saison junior avant de voir sa saison senior se terminer sur une blessure à la cheville.